針對八仙樂園粉塵爆炸意外事件，馬偕紀念醫院27日晚間台北及淡水兩院區均啟動「大量傷患機制」，包括醫師、護理、藥師及相關團隊與行政人員均全體總動員，許多未當班的醫療人員聞訊均主動返院幫忙處理如潮水湧來的傷患。依27日當天晚間統計急診的資料顯示，台北院區急診收治24名、淡水院區急診收治59名，兩院區共計收治83人。醫療團隊傾全力救治傷者，發揮絕佳的馬偕精神，提供最好的醫療照顧與關懷工作。
截至6月29日下午5:00 兩院區住院病人情況如下：
【台北院區】
共26名。分別為燙傷中心8名、加護病房11名、一般病房7名。
燙傷中心及加護病房的病人中14名患者燒燙傷面積達50%以上，其中有1位90%以上，2位80%，2位70%，13名病人目前仍插管使用呼吸器中。一般病房的病人中燒燙傷面積約10-30%。許多病人入院後已進行焦痂切除術，以利肢體末稍循環。
【淡水院區】
共30名。分別為加護病房11名、一般病房19名。
加護病房的病人中9名患者燒燙傷面積達50%以上，其中有2位90%以上，2位80%，2位70%；10名病人目前仍插管使用呼吸器中。一般病房的病人中燒燙傷面積約10-50%。許多病人入院後也已經接受焦痂切除術。
有鑑於此次大量傷患的治療與因應，馬偕紀念醫院並於今(29日)天召開緊急應變會議決議，台北院區除原有的燙傷病房外，外科加護病房也將騰出一區域作為臨時的燙傷加護病房，而原外科普通病房亦將劃分專區做為醫治病人之用。
淡水院區則清空神經加護病房11床做為臨時的燙傷加護病房使用，並於55病房一區域加裝隔離門後做為燙傷病房專區。而甫於六月完工的骨髓移植病房必要時亦可在完成行政程序後，先作為備援病房使用。
馬偕紀念醫院將成立特別任務分組，傾全力救治所有傷者，接下來的一段時間仍是病人的危險期，需要持續與積極的治療，請社會各界共同為這些在苦難中的傷者及家屬代禱。